Zain is twaalf jaar en woont in Libanon. Met 'dank' aan zijn nalatige ouders groeit hij op tot een straatslimme overlever. Nadat hij opgepakt wordt voor geweld, beslist hij rechtvaardigheid op te zoeken. Hij klaagt zijn ouders aan, omdat ze hem zonder zijn toestemming op de wereld gezet hebben.
Capharnaüm is een pakkende film over ouderschap, opgroeien en overleven in een ruwe wereld.